高敏PCR試劑盒(熔解確認版) ——快靈高敏試劑盒“PLUS”!
發(fa)布時間 : 2021-06-28 16:07:19自2020年10月上海快靈發布“非洲豬(zhu)瘟高敏(min)PCR試劑(ji)盒(he)”(下(xia)稱高敏(min)試劑(ji)盒(he))以(yi)(yi)(yi)來,其(qi)出(chu)色的(de)(de)(de)靈敏(min)度、敏(min)感性(xing)、特異性(xing)及穩定性(xing)迅(xun)速被廣大豬(zhu)場實驗(yan)室認可。隨著熒光PCR相關技術(shu)的(de)(de)(de)普及以(yi)(yi)(yi)及用戶群體的(de)(de)(de)增大,部(bu)分之前未被重(zhong)視的(de)(de)(de)問題也(ye)逐漸顯(xian)露(lu)出(chu)來。本篇(pian)我們探(tan)討(tao)下(xia)各廠家都諱莫如(ru)深的(de)(de)(de)一個點——“假陽”問題,以(yi)(yi)(yi)及相應的(de)(de)(de)解(jie)決方案。
“假陽(yang)”問題,事實上在(zai)熒光PCR領域并不(bu)少見(jian),而(er)造成假陽(yang)產生(sheng)的原因也(ye)是紛(fen)繁復雜:如操作(zuo)不(bu)當污(wu)染、環境氣(qi)溶膠污(wu)染或者(zhe)試(shi)劑(ji)(ji)生(sheng)產過程污(wu)染等。本文(wen)所(suo)要(yao)探討(tao)的“假陽(yang)”,主要(yao)指(zhi)因試(shi)劑(ji)(ji)特異(yi)性導致的假陽(yang),換句(ju)話說,即文(wen)中所(suo)提(ti)(ti)的“假陽(yang)”,與(yu)操作(zuo)者(zhe)、儀(yi)器、環境均無關(guan)(guan),只(zhi)與(yu)試(shi)劑(ji)(ji)盒(he)內的試(shi)劑(ji)(ji)有關(guan)(guan)。那么(me)試(shi)劑(ji)(ji)盒(he)中到底(di)什么(me)與(yu)“假陽(yang)”相(xiang)關(guan)(guan)呢(ni)?縱觀商業化的非(fei)瘟病毒PCR檢測試(shi)劑(ji)(ji)盒(he),其中都會提(ti)(ti)及一(yi)個重要(yao)參數(shu)——特異(yi)性。
何(he)為(wei)特異性(xing)呢?在(zai)PCR擴(kuo)增(zeng)過程中(zhong),如果(guo)我們要擴(kuo)增(zeng)的(de)(de)(de)非洲豬瘟DNA片(pian)(pian)段(duan)在(zai)整條DNA鏈上不止出現了一次,或者樣品中(zhong)混有的(de)(de)(de)其他物(wu)種、細胞或病(bing)毒的(de)(de)(de)DNA中(zhong)含有類似的(de)(de)(de)DNA片(pian)(pian)段(duan),則(ze)可(ke)能會將其他片(pian)(pian)段(duan)擴(kuo)增(zeng)出來(lai)(lai),那最(zui)后儀器(qi)顯示出來(lai)(lai)的(de)(de)(de)陽(yang)性(xing)結果(guo)就不一定是非瘟病(bing)毒DNA造成的(de)(de)(de),于是陽(yang)性(xing)結果(guo)也就變成了假(jia)(jia)陽(yang)。因此(ci),通俗來(lai)(lai)說,特異性(xing)反應的(de)(de)(de)是試劑盒能擴(kuo)增(zeng)出特定DNA片(pian)(pian)段(duan)的(de)(de)(de)性(xing)能,特異性(xing)越低,則(ze)試劑盒擴(kuo)增(zeng)其他片(pian)(pian)段(duan)的(de)(de)(de)概率(lv)就越大,即“假(jia)(jia)陽(yang)”幾率(lv)更大。
市售的(de)眾多非瘟病(bing)毒PCR檢(jian)測試(shi)劑盒中,絕(jue)大多數廠商(shang)在宣(xuan)傳其試(shi)劑盒特異(yi)(yi)性(xing)時均(jun)會標注>99%,最低也(ye)不會低于98%,快靈的(de)高敏(min)試(shi)劑盒也(ye)是如(ru)此,特異(yi)(yi)性(xing)可達到99.9%,屬(shu)實是已(yi)經做(zuo)到了(le)極限(xian),即(ji)使(shi)PCR技術發展至今(jin),因為模板DNA的(de)不確定,依(yi)然(ran)無(wu)法保證100%的(de)特異(yi)(yi)性(xing)。也(ye)正因此,特異(yi)(yi)性(xing),也(ye)就是假陽的(de)問題是被(bei)大家(jia)忽視了(le)。
在(zai)服務客(ke)(ke)戶(hu)的過(guo)程中,我們(men)發現很多客(ke)(ke)戶(hu)在(zai)進(jin)行非瘟病毒檢測(ce)遇(yu)到極弱樣本(ben)或疑似樣本(ben)時,對于陽性場,往(wang)往(wang)遵(zun)循的是“寧殺(sha)錯,不放過”,而對于(yu)陰(yin)性場,往往帶來(lai)(lai)心(xin)理的(de)(de)(de)恐慌,需要確(que)(que)認到底(di)是不是陽性。的(de)(de)(de)確(que)(que),隨著非瘟一(yi)波(bo)波(bo)的(de)(de)(de)襲(xi)來(lai)(lai),各檢(jian)測單(dan)位的(de)(de)(de)工作量都(dou)史無(wu)前例的(de)(de)(de)倍增(zeng),再重新來(lai)(lai)一(yi)遍的(de)(de)(de)全面復核,顯然是對人(ren)力和成本(ben)的(de)(de)(de)巨大(da)考驗。面對這樣(yang)的(de)(de)(de)大(da)環(huan)境,快靈(ling)人(ren)陷入了(le)沉思。
“我們為什么要(yao)寧殺(sha)錯?”
“當真沒有辦(ban)法消除假陽么?”
帶著這樣(yang)的問題(ti),我(wo)(wo)們開始了新的一(yi)(yi)輪又一(yi)(yi)輪的嘗試:提升(sheng)試劑(ji)盒的靈敏(min)度、將(jiang)特異性(xing)由(you)99%提升(sheng)至99.9%……或許,我(wo)(wo)們可(ke)以把眼界放寬,不局限于單純的擴增?
于(yu)是,高(gao)(gao)敏(min)試劑盒(he)上市半年(nian)后,我們在高(gao)(gao)敏(min)試劑盒(he)基(ji)礎之上研發出其(qi)“升(sheng)級版(ban)”——快(kuai)靈高(gao)(gao)敏(min)試劑盒(he)(熔解確認版(ban))。
快(kuai)靈高敏(min)試(shi)劑(ji)(ji)盒(he)(he)(he)(熔(rong)(rong)解(jie)確(que)認(ren)版),其性能(neng)參數與高敏(min)試(shi)劑(ji)(ji)盒(he)(he)(he)一致,我(wo)們(men)(men)同(tong)樣(yang)保證(zheng)其靈敏(min)度、敏(min)感(gan)性、穩(wen)定(ding)性、特異性處在行業頂尖(jian)水平,確(que)保客戶可(ke)以第(di)一時間(jian)檢(jian)測出陽性樣(yang)本。包(bao)括其操(cao)作、擴增階段也(ye)與高敏(min)試(shi)劑(ji)(ji)盒(he)(he)(he)別無二(er)致,至此,我(wo)們(men)(men)可(ke)以把快(kuai)靈高敏(min)試(shi)劑(ji)(ji)盒(he)(he)(he)(熔(rong)(rong)解(jie)確(que)認(ren)版)等同(tong)于高敏(min)試(shi)劑(ji)(ji)盒(he)(he)(he)。詳見(jian)表1:
表1:高敏試(shi)劑(ji)盒與假陽(yang)確(que)認試(shi)劑(ji)盒基本性能參數對比(bi)
性能 | 高(gao)敏試(shi)劑盒 | 高(gao)敏試劑盒(假陽確認(ren)版) |
靈敏度 | 400copies/mL | 400copies/mL |
敏感性 | ≥99.9% | ≥99.9% |
特(te)異性 | ≥99.9% | ≥99.9% |
穩定性 | CV<3% | CV<3% |
規格 | 50T/盒 | 50T/盒(he) |
反應體系(xi) | 25μL | 25μL |
反(fan)應時長(chang) | 55min | 55min(單擴增(zeng)) 70min(擴增(zeng)+熔(rong)解) |
UDG酶 | 有 | 有 |
內(nei)標 | 有(you) | 有(you) |
但,重點來了!快(kuai)靈是怎(zen)么做到的(de)(de)(de)?快(kuai)靈高敏(min)試劑(ji)盒(熔(rong)解(jie)確認版)突破性地(di)使用了一個(ge)新的(de)(de)(de)反應(ying)程序——熔(rong)解(jie)曲(qu)線。熔(rong)解(jie)曲(qu)線能鑒(jian)別不(bu)同的(de)(de)(de)DNA片(pian)段(duan),依靠的(de)(de)(de)不(bu)是Ct.值,而是其特有(you)的(de)(de)(de)熔(rong)解(jie)峰,即(ji)Tm值,即(ji)使一個(ge)DNA片(pian)段(duan)中僅相差一個(ge)堿基,都能導致Tm值變動。依靠Tm值的(de)(de)(de)判定就可以確認之前擴增陽(yang)性的(de)(de)(de)非(fei)瘟樣本是否為真的(de)(de)(de)非(fei)瘟陽(yang)性,以此達到鑒(jian)別假(jia)陽(yang),消除客戶疑(yi)慮(lv)的(de)(de)(de)目(mu)的(de)(de)(de)。
圖1:擴(kuo)增曲(qu)線Ct.值(zhi)判(pan)讀陰(yin)陽 圖2:熔解曲(qu)線檢測疑似/弱陽樣(yang)本,排除假(jia)陽
非(fei)瘟新(xin)形勢(shi)下,除了(le)要(yao)求試劑盒(he)更(geng)早的(de)檢測出陽(yang)性,更(geng)需(xu)要(yao)真(zhen)正(zheng)“精準”檢測。快靈(ling)高(gao)敏試劑盒(he)(熔(rong)解(jie)確認(ren)版(ban))除了(le)超(chao)高(gao)的(de)靈(ling)敏度(du)、特異性,更(geng)是“自帶(dai)”熔(rong)解(jie)曲線,讓假(jia)陽(yang)無(wu)處可(ke)藏(zang),讓弱(ruo)陽(yang)“站得(de)住腳(jiao)”,真(zhen)正(zheng)做到打消客戶(hu)疑慮(lv),真(zhen)正(zheng)做到“不殺錯、不放(fang)過(guo)”。